Genómica y filogenómica de Plasmodium
Reconstrucción de la historia evolutiva de los parásitos de la malaria humana a partir de genomas de alta calidad.
Ver más →Genómica de enfermedades infecciosas · Evolución · Bioinformática
Axl S. Cepeda
PhD en Biología (Temple University, 2026) · Investigador visitante, Laboratorio Escalante
Estudio la evolución de agentes de enfermedades infecciosas, principalmente la malaria y otros parásitos hemosporidios, y el virus mpox, combinando genómica comparada y poblacional, filogenómica y aprendizaje automático. También desarrollo el software que hace reproducibles estos análisis.
P. falciparum
P. reichenowi
P. gonderi
P. fragile
P. coatneyi
P. knowlesi
P. cynomolgi
P. inui
P. vivax
H. columbae
H. syrnii
Leucocytozoon
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Genomas producidos o mejorados en mi investigación
01
Líneas de investigación
Diversidad de hemosporidios y otros parásitos sanguíneos
Aves, reptiles y mamíferos como hospederos: límites de especie, diversidad críptica y ciclos de vida.
Ver más →Vigilancia molecular y evolución del virus mpox
Herramientas genómicas para rastrear la transmisión y evolución del virus mpox.
Ver más →Métodos computacionales y herramientas de aprendizaje automático
Flujos de trabajo y modelos en Python y R que convierten datos genómicos en resultados biológicos reproducibles.
Ver más →02
Todas las publicaciones →Publicaciones recientes
- 2026
New Insights into Plasmodium Evolution: How Genomics and Evolutionary Biology Contribute to Understanding Malaria
Cepeda, A. S.
PhD dissertation, Temple UniversityTesis doctoral
- 2025
Haemoproteus syrnii and other haemosporidians infecting owls from North America
Pacheco, M. A., Miller, E. A., Harl, J., Ferreira, F. C., Cepeda, A. S., Valkiūnas, G., Beckerman, S., Oswald, M., Mateus-Pinilla, N. E., Escalante, A. A.
Malaria Journal, 24, 365DOI: 10.1186/s12936-025-05612-2
- 2024
A new long-read mitochondrial-genome protocol (PacBio HiFi) for haemosporidian parasites: a tool for population and biodiversity studies
Pacheco, M. A., Cepeda, A. S., Miller, E. A., Beckerman, S., Oswald, M., London, E., Mateus-Pinilla, N. E., Escalante, A. A.
Malaria Journal, 23(1), 134DOI: 10.1186/s12936-024-04961-8
- 2024
The genome of Plasmodium gonderi: insights into the evolution of human malaria parasites
Cepeda, A. S., Mello, B., Pacheco, M. A., Luo, Z., Sullivan, S. A., Carlton, J. M., Escalante, A. A.
Genome Biology and Evolution, 16(2), evae027DOI: 10.1093/gbe/evae027